RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W KRE1P17260 313 aa3.68□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W BET1P22804 142 aa3.68□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W BSC4P53841 131 aa3.68□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W YOR072WQ08486 104 aa3.68□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W YDR010CQ12426 110 aa3.68□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W YGL149WP53116 101 aa3.67□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W YHR007C-AQ07074 71 aa3.67□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W YJR107C-AP0CT86 78 aa3.66□□□□□ -1.82
CIN4YMR138W DSE2P38844 325 aa3.65□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W OST2P46964 130 aa3.65□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W TDA8Q6B2U8 126 aa3.65□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.63□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W ATP18P81450 59 aa3.63□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.63□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YFR009W-AP0C5M9 85 aa3.62□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YBR027CP38220 110 aa3.62□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W RSM18P40033 138 aa3.62□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YNL184CP53876 108 aa3.62□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W TSC3Q3E790 80 aa3.62□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YHR139C-AO13536 103 aa3.6□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W YAR1P46683 200 aa3.6□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W KSH1Q8TGJ3 72 aa3.59□□□□□ -1.83
CIN4YMR138W RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W HOT13P36078 116 aa3.57□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W SHH4Q06236 168 aa3.57□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa3.57□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.57□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W ICS3P47034 131 aa3.56□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W COX23P38824 151 aa3.55□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W ECM19Q06011 112 aa3.55□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YLR162WQ06235 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W KTI11Q3E840 82 aa3.55□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YEL045CP32616 141 aa3.54□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.54□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa3.54□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W MIC10Q96VH5 97 aa3.54□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YCR085WP25650 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W ISD11Q6Q560 94 aa3.53□□□□□ -1.84
CIN4YMR138W YLR157W-DP0CE99 70 aa3.51□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YHL005CP38752 130 aa3.5□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YOL014WQ08110 124 aa3.5□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W CMC4Q3E7A9 73 aa3.5□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YCR050CP25630 102 aa3.47□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YAL063C-AQ3E791 96 aa3.47□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.47□□□□□ -1.85
CIN4YMR138W ATX1P38636 73 aa3.46□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W TDA2P40045 126 aa3.46□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W SOH1P38633 127 aa3.45□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W COF1Q03048 143 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W RAD6P06104 172 aa3.43□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W YHL042WP38729 150 aa3.43□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W RPL38P49167 78 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W ATP20Q12233 115 aa3.43□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W COX7P10174 60 aa3.42□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W YCR043CP25361 127 aa3.42□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W YHR073W-AP0C5N7 58 aa3.41□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W INO4P13902 151 aa3.41□□□□□ -1.86
CIN4YMR138W EMC6Q12431 108 aa3.4□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YSY6P38374 65 aa3.39□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YFL041W-AQ3E817 63 aa3.39□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YKL069WP36088 180 aa3.38□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YAR064WP39563 99 aa3.38□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YDL012CQ12489 107 aa3.38□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YOR304C-AO14468 76 aa3.37□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YLR285C-AQ3E771 56 aa3.36□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YGR164WP53291 111 aa3.35□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W SLO1Q3E784 85 aa3.35□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CIN4YMR138W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.33□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YER187WP40102 141 aa3.3□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YFL065CP43539 102 aa3.3□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YPL080CQ02826 108 aa3.3□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YPR153WQ06537 140 aa3.3□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YPR203WQ08994 102 aa3.3□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YLR361C-AQ3E795 98 aa3.29□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YOR316C-AQ3E806 69 aa3.29□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W LIP1Q03579 150 aa3.28□□□□□ -1.88
CIN4YMR138W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YOR314WQ12506 109 aa3.25□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.24□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W RUB1Q03919 77 aa3.23□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YDR246W-AQ3E763 66 aa3.23□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.23□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YGR039WP53225 103 aa3.22□□□□□ -1.89
CIN4YMR138W YJR128WP47162 119 aa3.21□□□□□ -1.9
CIN4YMR138W FYV12Q08559 129 aa3.21□□□□□ -1.9
CIN4YMR138W Q0017Q9ZZX8 53 aa3.21□□□□□ -1.9
CIN4YMR138W YLR255CO13574 117 aa3.19□□□□□ -1.9
CIN4YMR138W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms