RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		2.88	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YFL065C	P43539	102 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YAR1	P46683	200 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YPR203W	Q08994	102 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		2.87	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	PEX22	P39718	180 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.86	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	BET1	P22804	142 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YPR195C	Q06594	109 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	EMC6	Q12431	108 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.85	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	KRE1	P17260	313 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	YGL193C	P53097	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
LAS1	YKR063C	RAD6	P06104	172 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	DDR2	P89113	61 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	TDA2	P40045	126 aa		2.83	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YHL042W	P38729	150 aa		2.82	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	GAT4	P40569	121 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	BSC4	P53841	131 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YOR072W	Q08486	104 aa		2.81	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YSY6	P38374	65 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	ICS3	P47034	131 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		2.79	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	YGR039W	P53225	103 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	LCL1	Q02786	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	SHH4	Q06236	168 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	LCL2	Q08045	131 aa		2.78	□□□□□ -1.96
LAS1	YKR063C	COX23	P38824	151 aa		2.78	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	RSM18	P40033	138 aa		2.78	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		2.78	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.78	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	ATP20	Q12233	115 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.77	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	SPG1	P50088	95 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	MMS2	P53152	137 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YNL184C	P53876	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	ECM19	Q06011	112 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YCR050C	P25630	102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YLR162W	Q06235	118 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YOL014W	Q08110	124 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YEL045C	P32616	141 aa		2.72	□□□□□ -1.97
LAS1	YKR063C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YOR314W	Q12506	109 aa		2.71	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YBR027C	P38220	110 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YOR268C	Q08734	132 aa		2.7	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	TOM6	P33448	61 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YGL149W	P53116	101 aa		2.69	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.68	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YAR064W	P39563	99 aa		2.67	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YER187W	P40102	141 aa		2.67	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	YIL102C	P40488	101 aa		2.66	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
LAS1	YKR063C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.64	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	KTI11	Q3E840	82 aa		2.64	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.64	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	LIP1	Q03579	150 aa		2.63	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.63	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YFL067W	P43537	175 aa		2.63	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YPL080C	Q02826	108 aa		2.63	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YHL005C	P38752	130 aa		2.61	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YPR153W	Q06537	140 aa		2.61	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		2.61	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		2.6	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		2.59	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	YDL012C	Q12489	107 aa		2.59	□□□□□ -1.99
LAS1	YKR063C	COX7	P10174	60 aa		2.58	□□□□□ -2
LAS1	YKR063C	YDR010C	Q12426	110 aa		2.58	□□□□□ -2
LAS1	YKR063C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms