RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W YCR001WP25347 104 aa9.09□□□□□ -0.95
SSA4YER103W YLR162WQ06235 118 aa9.09□□□□□ -0.95
SSA4YER103W AQY2P0CD90 149 aa9.08□□□□□ -0.96
SSA4YER103W RPC10P40422 70 aa9.08□□□□□ -0.96
SSA4YER103W FYV5P25585 152 aa9.07□□□□□ -0.96
SSA4YER103W COX23P38824 151 aa9.07□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YOR268CQ08734 132 aa9.07□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YBL039W-BP0C268 59 aa9.07□□□□□ -0.96
SSA4YER103W SFT1P43682 97 aa9.07□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YHL005CP38752 130 aa9.06□□□□□ -0.96
SSA4YER103W RRT15Q3E811 62 aa9.06□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YGR121W-AQ3E816 71 aa9.06□□□□□ -0.96
SSA4YER103W Q0297Q9ZZV8 51 aa9.06□□□□□ -0.96
SSA4YER103W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YBR230W-AQ3E762 66 aa9.05□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YHR212W-AP0CX91 67 aa9.04□□□□□ -0.96
SSA4YER103W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SSA4YER103W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YJL127C-BQ3E828 52 aa9.03□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa9.03□□□□□ -0.96
SSA4YER103W YAL064WP39711 94 aa9.02□□□□□ -0.97
SSA4YER103W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa9.02□□□□□ -0.97
SSA4YER103W YOR381W-AQ3E804 55 aa9.02□□□□□ -0.97
SSA4YER103W YBR056W-AI2HB52 66 aa9□□□□□ -0.97
SSA4YER103W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SSA4YER103W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SSA4YER103W IGD1P43598 195 aa8.98□□□□□ -0.97
SSA4YER103W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa8.97□□□□□ -0.97
SSA4YER103W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa8.97□□□□□ -0.97
SSA4YER103W MLF3P32047 452 aa8.95□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YIL102CP40488 101 aa8.95□□□□□ -0.98
SSA4YER103W LIP1Q03579 150 aa8.94□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YGR035W-AQ45U48 73 aa8.94□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YDR274CP87283 123 aa8.93□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YLR307C-AQ3E825 87 aa8.93□□□□□ -0.98
SSA4YER103W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SSA4YER103W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SSA4YER103W MIC10Q96VH5 97 aa8.92□□□□□ -0.98
SSA4YER103W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa8.91□□□□□ -0.98
SSA4YER103W RPB9P27999 122 aa8.9□□□□□ -0.98
SSA4YER103W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SSA4YER103W SPC1P46965 94 aa8.9□□□□□ -0.98
SSA4YER103W YAR023CD6VPM8 179 aa8.9□□□□□ -0.99
SSA4YER103W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa8.9□□□□□ -0.99
SSA4YER103W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa8.9□□□□□ -0.99
SSA4YER103W DIF1O13577 133 aa8.88□□□□□ -0.99
SSA4YER103W HHF1P02309 103 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SSA4YER103W YBR144CP34215 104 aa8.88□□□□□ -0.99
SSA4YER103W YMR122CQ03879 124 aa8.88□□□□□ -0.99
SSA4YER103W ECM19Q06011 112 aa8.87□□□□□ -0.99
SSA4YER103W YDR115WQ04598 105 aa8.86□□□□□ -0.99
SSA4YER103W HOT13P36078 116 aa8.84□□□□□ -1
SSA4YER103W SGF11Q03067 99 aa8.83□□□□□ -1
SSA4YER103W PEX22P39718 180 aa8.82□□□□□ -1
SSA4YER103W Q0032Q9ZZX7 96 aa8.82□□□□□ -1
SSA4YER103W YEL045CP32616 141 aa8.82□□□□□ -1
SSA4YER103W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
SSA4YER103W OST5Q92316 86 aa8.8□□□□□ -1
SSA4YER103W YER188C-AP0C0V2 99 aa8.8□□□□□ -1
SSA4YER103W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SSA4YER103W TEL1P38110 2787 aa8.76□□□□□ -1.01
SSA4YER103W YPR153WQ06537 140 aa8.74□□□□□ -1.01
SSA4YER103W YHR007C-AQ07074 71 aa8.74□□□□□ -1.01
SSA4YER103W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa8.74□□□□□ -1.01
SSA4YER103W SAP30P38429 201 aa8.73□□□□□ -1.01
SSA4YER103W BSC4P53841 131 aa8.72□□□□□ -1.01
SSA4YER103W YOR072WQ08486 104 aa8.71□□□□□ -1.02
SSA4YER103W SNA2P56508 79 aa8.69□□□□□ -1.02
SSA4YER103W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa8.69□□□□□ -1.02
SSA4YER103W DDR2P89113 61 aa8.68□□□□□ -1.02
SSA4YER103W YDR010CQ12426 110 aa8.68□□□□□ -1.02
SSA4YER103W RTC6O14464 93 aa8.66□□□□□ -1.02
SSA4YER103W YAR064WP39563 99 aa8.66□□□□□ -1.02
SSA4YER103W SDH6Q3E785 79 aa8.65□□□□□ -1.02
SSA4YER103W HUB1Q6Q546 73 aa8.65□□□□□ -1.02
SSA4YER103W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data8.64□□□□□ -1.03not detected
SSA4YER103W YLR157W-DP0CE99 70 aa8.63□□□□□ -1.03
SSA4YER103W YHR125WP38831 101 aa8.63□□□□□ -1.03
SSA4YER103W MMS2P53152 137 aa8.62□□□□□ -1.03
SSA4YER103W YGL041C-BQ3E750 60 aa8.62□□□□□ -1.03
SSA4YER103W YGL193CP53097 103 aa8.6□□□□□ -1.03
SSA4YER103W YGL015CP33199 130 aa8.6□□□□□ -1.03
SSA4YER103W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa8.6□□□□□ -1.03
SSA4YER103W AUA1P32450 94 aa8.58□□□□□ -1.04
SSA4YER103W YOR376W-AQ3E805 51 aa8.58□□□□□ -1.04
SSA4YER103W YJL197C-AP0C5P0 93 aa8.57□□□□□ -1.04
SSA4YER103W YCR095W-AQ3E787 52 aa8.56□□□□□ -1.04
SSA4YER103W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SSA4YER103W YGL034CP53186 121 aa8.52□□□□□ -1.04
SSA4YER103W YCR043CP25361 127 aa8.52□□□□□ -1.05
SSA4YER103W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa8.52□□□□□ -1.05
SSA4YER103W MEC1P38111 2368 aa8.48□□□□□ -1.05
SSA4YER103W YML100W-AQ8TGT0 57 aa8.46□□□□□ -1.05
SSA4YER103W YBR027CP38220 110 aa8.44□□□□□ -1.06
SSA4YER103W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa8.43□□□□□ -1.06
SSA4YER103W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SSA4YER103W RPL43BP0CX26 92 aa8.42□□□□□ -1.06
SSA4YER103W YDL012CQ12489 107 aa8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.3 ms