RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	LCT	P09848	1927 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	AP1G2	O75843	785 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	APOC2	P02655	101 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	MAP3K7CL	P57077	242 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SKOR1	P84550	965 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PGBD4	Q96DM1	585 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SEPT4	O43236	478 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ASGR1	P07306	291 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CD52	P31358	61 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	STX2	P32856	288 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	LILRA4	P59901	499 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	IRF5	Q13568	498 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	NPNT	Q6UXI9	565 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	FAM131B	Q86XD5	332 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SCN4A	P35499	1836 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CLDN5	O00501	218 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PCSK1	P29120	753 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	STAT4	Q14765	748 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CASC4	Q6P4E1	433 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TRIB2	Q92519	343 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	KLC2	Q9H0B6	622 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	EPN3	Q9H201	632 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CHN1	P15882	459 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	YY1	P25490	414 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	KCNA10	Q16322	511 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ABI1	Q8IZP0	508 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TBCB	Q99426	244 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	RASA4B	C9J798	803 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	RASA4	O43374	803 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CDH16	O75309	829 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ITGAV	P06756	1048 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SP3	Q02447	781 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ADAM2	Q99965	735 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GJD2	Q9UKL4	321 aa		10.18	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888		F5H423	210 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	BRAF	P15056	766 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CYP3A5	P20815	502 aa		10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	LHX1	P48742	406 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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