RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 ALFQ53S48 1182 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L6PQ6QN14 398 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR149Q86SP6 731 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TMPRSS6Q8IU80 811 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CPOQ8IVL8 374 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM109AQ8N4B1 249 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SUN3Q8TAQ9 357 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ABHD5Q8WTS1 349 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GLG1Q92896 1179 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 C8orf49Q96NF6 230 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 UBA5Q9GZZ9 404 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 KLC2Q9H0B6 622 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GALNT9Q9HCQ5 603 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RIC8AQ9NPQ8 531 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 INTS13Q9NVM9 706 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 DKK2Q9UBU2 259 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS51Q9UID3 782 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNE5Q9UJ90 142 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FEM1BQ9UK73 627 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ASAP1Q9ULH1 1129 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 DAPP1Q9UN19 280 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 LZTS1Q9Y250 596 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TCAF1Q9Y4C2 921 aa2.59□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 A1L4Q6 167 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A18PA6NE21 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A16PA6NEW6 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 OR2W5A6NFC9 320 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 H0Y3Z8 333 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 M0QYT0 321 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 EXOC5O00471 708 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM24O15164 1050 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 DHHO43323 396 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CA12O43570 354 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SNX2O60749 519 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM155BO75949 473 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CDKL5O76039 1030 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CHRM2P08172 466 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 C1SP09871 688 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A15PP0C7V4 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM90A14PP0C7W9 464 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 LAG3P18627 525 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ACRV1P26436 265 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 HTR7P34969 479 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ADD2P35612 726 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE6CP51160 858 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CLCN2P51788 898 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SEC24CP53992 1094 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PDE1AP54750 535 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TIRAPP58753 221 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 DEUP1Q05D60 604 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 POU5F1BQ06416 359 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP1A4Q13733 1029 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS6KA2Q15349 733 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TBCCQ15814 346 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TAF12Q16514 161 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 NRN1LQ496H8 165 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC24Q50LG9 513 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 HS1BP3Q53T59 392 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TREML2Q5T2D2 321 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CERCAMQ5T4B2 595 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD45Q5TZF3 282 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 TANGO2Q6ICL3 276 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 GRHL2Q6ISB3 625 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC70Q6NSX1 233 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 MSANTD2Q6P1R3 559 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 RFX8Q6ZV50 586 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SYT13Q7L8C5 426 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 RASGRP2Q7LDG7 609 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 MAVSQ7Z434 540 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 KRT73Q86Y46 540 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 GATAD2AQ86YP4 633 aa2.58□□□□□ -2
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms