RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631037.2

LINC00969-333, human

TSL 5

Gene LINC00969, Length 451 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00969-333	ENST00000631037	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	CER1	O95813	267 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	NDUFV2	P19404	249 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	PRPH	P41219	470 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	GAD2	Q05329	585 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	ME3	Q16798	604 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	ZNF843	Q8N446	348 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.9	□□□□□ -0.66
LINC00969-333	ENST00000631037	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	E2F8	A0AVK6	867 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CAPN9	O14815	690 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	JAK2	O60674	1132 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	HUS1	O60921	280 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	NDUFS2	O75306	463 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PCSK1	P29120	753 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	LHX1	P48742	406 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	KDSR	Q06136	332 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	NECAB1	Q8N987	351 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TERB1	Q8NA31	727 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	GABRG3	Q99928	467 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	RNF38	Q9H0F5	515 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	DEC1	Q9P2X7	70 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	HCN2	Q9UL51	889 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		10.89	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037		J3QKU1	62 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CILP	O75339	1184 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TULP3	O75386	442 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	IL18RAP	O95256	599 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	MATK	P42679	507 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ACOT2	P49753	483 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ZNF131	P52739	623 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	GTF2B	Q00403	316 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PTPRN	Q16849	979 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	SDE2	Q6IQ49	451 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	GAREM1	Q9H706	876 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037		K7ENM7	598 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	GFRA2	O00451	464 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TNFSF14	O43557	240 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	HLA-E	P13747	358 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CD6	P30203	668 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	FOSB	P53539	338 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ANAPC15	P60006	121 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	USP46	P62068	366 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	IL17A	Q16552	155 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	ADAL	Q6DHV7	355 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LINC00969-333	ENST00000631037	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		10.87	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms