RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	TFDP2	Q14188	446 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMED2	Q15363	201 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TAZ	Q16635	292 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	HIF1A	Q16665	826 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARMCX2	Q7L311	632 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF410	Q86VK4	478 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFX6	Q8HWS3	928 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TFAP2B	Q92481	460 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	OPTN	Q96CV9	577 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAGEB18	Q96M61	343 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMC6	Q96SB8	1091 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RSAD1	Q9HA92	442 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	POLI	Q9UNA4	740 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	AKT3	Q9Y243	479 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	9.64	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CFAP69	A5D8W1	941 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	LACTBL1	A8MY62	500 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RASA4B	C9J798	803 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	B4GALT5	O43286	388 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RASA4	O43374	803 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRCH4	O75427	683 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPAG6	O75602	509 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MICAL2	O94851	1124 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	GJB6	O95452	261 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	APOC2	P02655	101 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPD1	P21695	349 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	GABRB2	P47870	512 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	OGDH	Q02218	1023 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ARHGAP1	Q07960	439 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	INCA1	Q0VD86	236 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCDC38	Q502W7	563 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	JADE1	Q6IE81	842 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	VSIG1	Q86XK7	387 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	XYLT1	Q86Y38	959 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCTD6	Q8NC69	237 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MGARP	Q8TDB4	240 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCT6B	Q92526	530 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	HPDL	Q96IR7	371 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACAP3	Q96P50	834 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CNPY3	Q9BT09	278 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZWILCH	Q9H900	591 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF181	Q9P0P0	153 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIX4	Q9UIU6	781 aa		9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ALOX15B	O15296	676 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRPSAP2	O60256	369 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	CST8	O60676	142 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	TOMM70	O94826	608 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFNB1	P01574	187 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERBB2	P04626	1255 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	INSRR	P14616	1297 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	KRT15	P19012	456 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	KDELR1	P24390	212 aa		9.62	□□□□□ -0.87
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms