RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MARK4	Q96L34	752 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397		A0A1W2PPL8	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TLR2	O60603	784 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	OAZ2	O95190	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	KIT	P10721	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DIO1	P49895	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	NEK2	P51955	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397		H3BML4	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	UBXN7	O94888	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ALPL	P05186	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CREB1	P16220	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	EPHA3	P29320	983 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ID2	Q02363	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SEC23B	Q15437	767 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	UQCRC1	P31930	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ME1	P48163	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TIRAP	P58753	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	RAB32	Q13637	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PIM3	Q86V86	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397		H3BNX3	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SPRY2	O43597	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RGS10	O43665	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CTSA	P10619	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	THBS3	P49746	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CFHR1	Q03591	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	INSC	Q1MX18	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	RASAL1	O95294	804 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	PSG1	P11464	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	HSPA6	P17066	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	MTHFS	P49914	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	CFHR3	Q02985	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TIMM9-210	ENST00000557397	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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