RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556402.5

ETFRF1-208, Transcript of electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, human

TSL 3 BASIC

Gene ETFRF1, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETFRF1-208	ENST00000556402	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	FANCB	Q8NB91	859 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MAML1	Q92585	1016 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	EVI5L	Q96CN4	794 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MED16	Q9Y2X0	877 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TMX2	Q9Y320	296 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CCDC189	A1A4V9	331 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SMIM22	K7EJ46	135 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF213	O14771	459 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TBC1D4	O60343	1298 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	FGF18	O76093	207 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ENG	P17813	658 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	VIPR2	P41587	438 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	PCID2	Q5JVF3	399 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CCDC174	Q6PII3	467 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	GLG1	Q92896	1179 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	REPS1	Q96D71	796 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	JTB	O76095	146 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC11A2	P49281	568 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF81	P51508	661 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	E2F2	Q14209	437 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TBC1D5	Q92609	795 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	R3HDM4	Q96D70	268 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF778	Q96MU6	729 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	DPH1	Q9BZG8	443 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	GLOD4	Q9HC38	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402		A0A087WV62	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402		A1L4Q6	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MYO1C	O00159	1063 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ONECUT2	O95948	504 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CHKA	P35790	457 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TEC	P42680	631 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	HSPA7	P48741	367 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CTBP1	Q13363	440 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	PROSER3	Q2NL68	480 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	PPM1E	Q8WY54	764 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CEP83	Q9Y592	693 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402		A0A1W2PPC4	97 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	PAX3	P23760	479 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CYP4F2	P78329	520 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ELF2	Q15723	593 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MPEG1	Q2M385	716 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	MICU3	Q86XE3	530 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SLC15A4	Q8N697	577 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ETFRF1-208	ENST00000556402	TMEM233	B4DJY2	109 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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