RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 MSANTD3Q96H12 275 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 DUSP16Q9BY84 665 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 COMMD8Q9NX08 183 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CPQQ9Y646 472 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CYP26A1O43174 497 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 MRE11P49959 708 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PDE6CP51160 858 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 MTAPQ13126 283 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GAS6Q14393 721 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PON2Q15165 354 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PDGFRLQ15198 375 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 EML3Q32P44 896 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 MLKLQ8NB16 471 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GPT2Q8TD30 523 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CHRDQ9H2X0 955 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 OSER1Q9NX31 292 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 NCAM2O15394 837 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 P4HA2O15460 535 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 NBL1P41271 181 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 MAGEA9P43362 315 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TTC30AQ86WT1 665 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 NT5C1BQ96P26 610 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 SCML2Q9UQR0 700 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PATJQ8NI35 1801 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 SP9P0CG40 484 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TUBP50607 506 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 KIF11P52732 1056 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 HECTD3Q5T447 861 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 Q6ZS52 159 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 WBP2Q969T9 261 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ECT2Q9H8V3 914 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 NMUR1Q9HB89 426 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TULP2O00295 520 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TBX18O95935 607 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CCDC192P0DO97 292 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 IFNAR2P48551 515 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CCINQ13939 588 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 SCD5Q86SK9 330 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 USP3Q9Y6I4 520 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 PROB1E7EW31 1015 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TLR5O60602 858 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CALCAP01258 141 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GJA4P35212 333 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 GAB4Q2WGN9 574 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 RRAGAQ7L523 313 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 CPA6Q8N4T0 437 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 TFAP2BQ92481 460 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 R4GN57 208 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-222ENST00000550996 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 FRYLO94915 3013 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PQH9 124 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 O00370 1275 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 LAMTOR5O43504 91 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TSSK4Q6SA08 328 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 TMEM270Q6UE05 265 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-222ENST00000550996 PIGZQ86VD9 579 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms