RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 MOXD1Q6UVY6 613 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 KCNK18Q7Z418 384 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 NELFBQ8WX92 580 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 EXTL1Q92935 676 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CALML4Q96GE6 196 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SCYL1Q96KG9 808 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TRIM9Q9C026 710 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MS4A5Q9H3V2 200 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 RMND1Q9NWS8 449 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 BTBD7Q9P203 1132 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 OAZ3Q9UMX2 235 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SCN9AQ15858 1988 aa6□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 LCHNA4D1U4 455 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 USP27XA6NNY8 438 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MATN2O00339 956 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FCER1AP12319 257 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 AOAHP28039 575 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MC4RP32245 332 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SREBF1P36956 1147 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FNTBP49356 437 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 STAT2P52630 851 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 DGCR2P98153 550 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 STK4Q13043 487 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 DUSP8Q13202 625 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TERF2Q15554 542 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 USH1GQ495M9 461 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FAM160B2Q86V87 743 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TMEM139Q8IV31 216 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CHURC1Q8WUH1 139 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 RAD54LQ92698 747 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 LENG9Q96B70 501 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 C16orf92Q96LL3 132 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 UIMC1Q96RL1 719 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZMAT4Q9H898 229 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 VTA1Q9NP79 307 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 HACL1Q9UJ83 578 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FEM1BQ9UK73 627 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.99□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SIPA1L1O43166 1804 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TRIM49BA6NDI0 452 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 E9PMD0 336 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FAM86B1E9PN63 330 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TBX3O15119 743 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MSH4O15457 936 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 SLC26A4O43511 780 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ULK1O75385 1050 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 MED24O75448 989 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 KATNA1O75449 491 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ASNSP08243 561 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FAM86B2P0C5J1 330 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CR2P20023 1033 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CCNE1P24864 410 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 LSP1P33241 339 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 FHL2Q14192 279 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 LRRC32Q14392 662 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 KRT31Q15323 416 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TBR1Q16650 682 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 KRT79Q5XKE5 535 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TTI2Q6NXR4 508 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CCDC174Q6PII3 467 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 UNC13DQ70J99 1090 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 TC2NQ8N9U0 490 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.98□□□□□ -1.45
TRDN-205ENST00000546248 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms