RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	REST	Q13127	1097 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC14A1	Q13336	389 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MCTP1	Q6DN14	999 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DYM	Q7RTS9	669 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM25	Q86YD3	366 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NAT16	Q8N8M0	369 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HPDL	Q96IR7	371 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	EPSTI1	Q96J88	318 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SPACA7	Q96KW9	195 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ACCS	Q96QU6	501 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CD93	Q9NPY3	652 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PQD8	194 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PRRT4	C9JH25	899 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	AP5Z1	O43299	807 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	COCH	O43405	550 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KRT19	P08727	400 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CISD3	P0C7P0	127 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MAOB	P27338	520 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXD13	P35453	343 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	BNC1	Q01954	994 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GAD2	Q05329	585 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KDSR	Q06136	332 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GLRX5	Q86SX6	157 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PGBD3	Q8N328	593 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GABRG3	Q99928	467 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM9	Q9C026	710 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ITPR1	Q14643	2758 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM92A	A1XBS5	289 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CLDN5	O00501	218 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM66	O15016	1216 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TACC1	O75410	805 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ADH1C	P00326	375 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFV2	P19404	249 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NTSR1	P30989	418 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	WAS	P42768	502 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP27A1	Q02318	531 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	NUP93	Q8N1F7	819 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	TERB1	Q8NA31	727 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MDM1	Q8TC05	714 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	OTUB2	Q96DC9	234 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNK16	Q96T55	309 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RBM4B-208	ENST00000534198	DEC1	Q9P2X7	70 aa		9.24	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms