RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PR48	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GOLIM4	O00461	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	UBXN7	O94888	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GPD1	P21695	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ADD2	P35612	726 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CXADR	P78310	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRKG2	Q13237	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BLMH	Q13867	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	AOX1	Q06278	1338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		H3BNC9	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GFPT2	O94808	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ALDH2	P05091	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRR35	P0CG20	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SLC9A1	P19634	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	AGXT	P21549	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PHC1	P78364	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ICA1	Q05084	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ANO4	Q32M45	955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	USP45	Q70EL2	814 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NAIP	Q13075	1403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		H7C1D1	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KDM1A	O60341	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TMCC2	O75069	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MOSPD3	O75425	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	OSM	P13725	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GLUL	P15104	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RAD52	P43351	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MTNR1B	P49286	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TUBA4A	P68366	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		E9PCH4	1651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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