RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MVB12AQ96EY5 273 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAFFQ9ULX9 164 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LACTBL1A8MY62 500 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 THP07101 528 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTSAP10619 480 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CREB1P16220 341 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPA2P48052 419 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIO1P49895 249 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC23BQ15437 767 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CERCAMQ5T4B2 595 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSTM1Q6UX27 236 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEF8Q6ZN54 512 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTAGE1Q96RT6 745 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 STAP2Q9UGK3 403 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP22Q9UPT9 525 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED16Q9Y2X0 877 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG1L2C9J202 215 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOMM40O96008 361 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 EVA1CP58658 441 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 YPEL5P62699 121 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHDQ02161 417 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFHR1Q03591 330 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HYAL1Q12794 435 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 STIM1Q13586 685 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNIQ14094 377 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF585BQ52M93 769 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP4Q96MN2 994 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K14Q99558 947 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZPBPQ9BS86 351 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RGS10O43665 173 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC25AP30304 524 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTX1Q13505 466 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZTC4 211 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP21Q8N119 569 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CGRRF1Q99675 332 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ICKQ9UPZ9 632 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WWL8 130 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0R3H8 397 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS11DO60235 418 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRGAP2O75044 1071 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASAL1O95294 804 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH2P05091 517 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPHA3P29320 983 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TACR3P29371 465 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 THBS4P35443 961 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCAT1P54687 386 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTBP1Q13363 440 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGL2Q14314 439 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT78Q8N1N4 520 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PELI3Q8N2H9 469 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms