RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 PDHA1P08559 390 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 C1SP09871 688 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ITGAMP11215 1152 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 INSRRP14616 1297 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PPP3CBP16298 524 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF20P17024 532 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TYRP1P17643 537 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NR4A1P22736 598 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NTSR1P30989 418 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 BMPR1AP36894 532 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GRK6P43250 576 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MTHFSP49914 203 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PDE6CP51160 858 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PGDP52209 483 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 BIRC3Q13489 604 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CCNIQ14094 377 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PRR16Q569H4 304 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CERCAMQ5T4B2 595 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MANEALQ5VSG8 457 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MZT2AQ6P582 158 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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POLR1B-215ENST00000498054 PPM1EQ8WY54 764 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM2Q99965 735 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GDF15Q99988 308 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NEO1Q92859 1461 aa5.05□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC189A1A4V9 331 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MARCH11A6NNE9 402 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 NPC1O15118 1278 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF6BO95407 300 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 EGR1P18146 543 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GATMP50440 423 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 DGCR2P98153 550 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SP2Q02086 613 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GPS1Q13098 491 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TIGD6Q17RP2 521 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 LY6KQ17RY6 165 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SSH3Q8TE77 659 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RUBCNQ92622 972 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 HAS1Q92839 578 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM5Q9C035 493 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEH1Q9H213 219 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 LUZP4Q9P127 313 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 USP22Q9UPT9 525 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KIF27Q86VH2 1401 aa5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ACKR2O00590 384 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KCNQ3O43525 872 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ASNA1O43681 348 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CSF1RP07333 972 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 UQCRC1P31930 480 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RENBPP51606 427 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PRKG1Q13976 671 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PTK2BQ14289 1009 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 C4orf46Q504U0 113 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GPR149Q86SP6 731 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 KRT73Q86Y46 540 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.03□□□□□ -1.6
POLR1B-215ENST00000498054 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.03□□□□□ -1.6
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