RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RAB1AP62820 205 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MLC1Q15049 377 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 C4orf46Q504U0 113 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PLA1AQ53H76 456 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 HPS3Q969F9 1004 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 STAP2Q9UGK3 403 aa4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 B4DGG1 531 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 M0R3H8 397 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 SPRY2O43597 315 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RNF8O76064 485 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 FGF2P09038 288 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PHKG2P15735 406 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ME1P48163 572 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CTBP1Q13363 440 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TMEM65Q6PI78 240 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.06□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 A0A088AWK7 358 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TMEM233B4DJY2 109 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MYO1CO00159 1063 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PSMD9O00233 223 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 NPR1P16066 1061 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 BCAT1P54687 386 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CCNIQ14094 377 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RANBP10Q6VN20 620 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PIM3Q86V86 326 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 KAZALD1Q96I82 304 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TRMOQ9BU70 441 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 DPH1Q9BZG8 443 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PROCRQ9UNN8 238 aa4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MTX1Q13505 466 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 FGL2Q14314 439 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ANO7Q6IWH7 933 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.04□□□□□ -1.76
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GINS1-202ENST00000473460 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 NT5C1BQ96P26 610 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MAP3K14Q99558 947 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.04□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 BTN3A1O00481 513 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 TIRAPP58753 221 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 YPEL5P62699 121 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 SLC14A1Q13336 389 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 KCNB1Q14721 858 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 NPY5RQ15761 445 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 MAML1Q92585 1016 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.03□□□□□ -1.76
GINS1-202ENST00000473460 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.03□□□□□ -1.76
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GINS1-202ENST00000473460 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.02□□□□□ -1.77
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GINS1-202ENST00000473460 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.02□□□□□ -1.77
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GINS1-202ENST00000473460 MMP21Q8N119 569 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 TRIM5Q9C035 493 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS1-202ENST00000473460 SNX15Q9NRS6 342 aa4.02□□□□□ -1.77
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