RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 CNGA4Q8IV77 575 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CLEC4CQ8WTT0 213 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 HSFY1Q96LI6 401 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NOX5Q96PH1 765 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CPXM1Q96SM3 734 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 DNAJC7Q99615 494 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MIS12Q9H081 205 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SYNCQ9H7C4 482 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 COMMD8Q9NX08 183 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 IL37Q9NZH6 218 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SCML2Q9UQR0 700 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 USP3Q9Y6I4 520 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PATJQ8NI35 1801 aa9.3□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PQH9 124 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 FAM92AA1XBS5 289 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ERBB2P04626 1255 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ACADSBP45954 432 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PGFP49763 221 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NOMO3P69849 1222 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 C2CD6Q53TS8 623 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 GPR158Q5T848 1215 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TXNDC8Q6A555 127 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 WDR59Q6PJI9 974 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 POTEHQ6S545 545 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ERICH1Q86X53 443 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TC2NQ8N9U0 490 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 STK32AQ8WU08 396 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 FGF13Q92913 245 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ASB2Q96Q27 587 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MYADMQ96S97 322 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SYT11Q9BT88 431 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NAGPAQ9UK23 515 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 CDH7Q9ULB5 785 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.29□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NOTCH4Q99466 2003 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 C2orf78A6NCI8 922 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 E7ENQ6 273 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO21O94952 628 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PPP3CCP48454 512 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MRE11P49959 708 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 DAOAP59103 153 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 GSE1Q14687 1217 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 ARID5BQ14865 1188 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.28□□□□□ -0.92
CASQ1-202ENST00000467691 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms