RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 PPP2R5EQ16537 467 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RAB6CQ53S08 254 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RAB41Q5JT25 222 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 EFHC1Q5JVL4 640 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC43Q8N309 656 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RAPGEF5Q92565 580 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CFAP57Q96MR6 1250 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SLITRK1Q96PX8 696 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 PEBP4Q96S96 227 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 KCNK16Q96T55 309 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 OSBPL8Q9BZF1 889 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 GPR62Q9BZJ7 368 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RAB6CQ9H0N0 254 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC4Q9HBW1 653 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 GDF3Q9NR23 364 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 STIM2Q9P246 746 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 MTUS1Q9ULD2 1270 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TANC1Q9C0D5 1861 aa10□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 HSF2BPO75031 334 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 DGKIO75912 1065 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RNF8O76064 485 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FBXO21O94952 628 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 EFEMP2O95967 443 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ALDH2P05091 517 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 GLI1P08151 1106 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 OR4Q2P0C623 313 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CSF2RAP15509 400 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FGFR3P22607 806 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SDC4P31431 198 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CHRNA3P32297 505 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CDKN2BP42772 138 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 PTGIRP43119 386 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFV1P49821 464 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RABGGTBP53611 331 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 BCAR1P56945 870 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 DAOAP59103 153 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 COPS2P61201 443 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TAZQ16635 292 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TTC27Q6P3X3 843 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FUT10Q6P4F1 479 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 MFSD7Q6UXD7 560 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SCML4Q8N228 414 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SLC2A13Q96QE2 648 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 CWH43Q9H720 699 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 LRRC19Q9H756 370 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ZWILCHQ9H900 591 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 AMACRQ9UHK6 382 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 USP18Q9UMW8 372 aa9.99□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TSC2P49815 1807 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 LRRD1A4D1F6 860 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FAM187AA6NFU0 413 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 OR6C75A6NL08 312 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 TBC1D4O60343 1298 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ENDOD1O94919 500 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 AMHP03971 560 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 MYBL2P10244 700 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 BDNFP23560 247 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 PBX3P40426 434 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 MATKP42679 507 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 FNTAP49354 379 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ARSEP51690 589 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 HDAC4P56524 1084 aa9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SRPRB-202ENST00000466636 ATP11AP98196 1134 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms