RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 GNAI1P63096 354 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKG2Q13237 762 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 GRM1Q13255 1194 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 POC1BQ8TC44 478 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 BRD9Q9H8M2 597 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 RLIMQ9NVW2 624 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-204ENST00000461653 ITIH6Q6UXX5 1313 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 NUP160Q12769 1436 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR27A2RRH5 827 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TMCC2O75069 709 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GJD2Q9UKL4 321 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.4□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.552e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPKBP1O60336 1514 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIN2AQ12879 1464 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 KAT6AQ92794 2004 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0B4J269 797 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 VWC2LB2RUY7 222 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLIM4O00461 696 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 BAIAP3O94812 1187 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GJB1P08034 283 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 KRT20P35900 424 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD52P43351 418 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TUBB3Q13509 450 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM153CQ494X1 144 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF220Q5VTB9 566 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 RSPH1Q8WYR4 309 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 KLC4Q9NSK0 619 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ETAA1Q9NY74 926 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 F5H697 171 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TIPRLO75663 272 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 UBXN7O94888 489 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFV1P49821 464 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ICA1Q05084 483 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 BLMHQ13867 455 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GGT6Q6P531 493 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 NPNTQ6UXI9 565 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 DPP9Q86TI2 863 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 DENND1CQ8IV53 801 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 C3orf20Q8ND61 904 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SOAT2O75908 522 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CHEK2O96017 543 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 RHOP08100 348 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GLULP15104 373 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ITPKBP27987 946 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3CGP48736 1102 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TAF12Q16514 161 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM209BQ5JX69 171 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 MVB12AQ96EY5 273 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PBKQ96KB5 322 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 HAPLN3Q96S86 360 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SIK2Q9H0K1 926 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR35Q9HC97 309 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms