RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 HOXB2P14652 356 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 NAT16Q8N8M0 369 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 PCED1BQ96HM7 432 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 ACCSQ96QU6 501 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRA-208ENST00000455631 F8VP50 259 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SH3BP5O60239 455 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PDGFRBP09619 1106 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 GAD2Q05329 585 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 GRIN1Q05586 938 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TAF10Q12962 218 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 DPH6Q7L8W6 267 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 H3BQV1 296 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 WASP42768 502 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PNPLA1Q8N8W4 532 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 HPDLQ96IR7 371 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 STRA6Q9BX79 667 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 A0A1W2PQD8 194 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 GCNT3O95395 438 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 GARTP22102 1010 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SLC14A1Q13336 389 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 NAXDQ8IW45 347 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 C8orf48Q96LL4 319 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 DEC1Q9P2X7 70 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SEL1LQ9UBV2 794 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ITPR1Q14643 2758 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 E2F8A0AVK6 867 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF217O75362 1048 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TULP3O75386 442 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TERB1Q8NA31 727 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 MMS19Q96T76 1030 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 NTSR1P30989 418 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 ANO4Q32M45 955 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 MDM1Q8TC05 714 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 OTUB2Q96DC9 234 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 INTS13Q9NVM9 706 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 PTPRJQ12913 1337 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 A0A1W2PQF6 199 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 GJB3O75712 270 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 TNNC2P02585 160 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFV2P19404 249 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CASP5P51878 434 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 CACNA2D1P54289 1103 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 MIB1Q86YT6 1006 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 LAMA5O15230 3695 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRA-208ENST00000455631 COCHO43405 550 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFS2O75306 463 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 GAP43P17677 238 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 BBS7Q8IWZ6 715 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 CHPFQ8IZ52 775 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 GPD1LQ8N335 351 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO32Q969P5 355 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRA-208ENST00000455631 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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