RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454859.7

ECHDC1-210, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-210ENST00000454859 LRRC43Q8N309 656 aa7.15□□□□□ -1.26
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ECHDC1-210ENST00000454859 C8orf48Q96LL4 319 aa7.15□□□□□ -1.26
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ECHDC1-210ENST00000454859 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.15□□□□□ -1.26
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ECHDC1-210ENST00000454859 SNF8Q96H20 258 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SPATA17Q96L03 361 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CASD1Q96PB1 797 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 NPY6RQ99463 290 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 FMO2Q99518 471 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 IL37Q9NZH6 218 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 LRRD1A4D1F6 860 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC1-210ENST00000454859 LIASO43766 372 aa7.13□□□□□ -1.27
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