RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439421.2

AL355500.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL355500.1, Length 297 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL355500.1-201ENST00000439421 SERPINF2P08697 491 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PDGFRBP09619 1106 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 GAD2Q05329 585 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 RING1Q06587 406 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TAF10Q12962 218 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 C8orf34Q49A92 452 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 EMC10Q5UCC4 262 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TERB1Q8NA31 727 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SNX25Q9H3E2 840 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CAPN10Q9HC96 672 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 FSCN3Q9NQT6 498 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TMEM30AQ9NV96 361 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 NME7Q9Y5B8 376 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13.06□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF233A6NK53 670 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 HOXB2P14652 356 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 GABRG2P18507 467 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 STAT6P42226 847 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CACNA2D1P54289 1103 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 LRSAM1Q6UWE0 723 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 FBXO32Q969P5 355 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PANK4Q9NVE7 773 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CLIC4Q9Y696 253 aa13.05□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CHD6Q8TD26 2715 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 COCHO43405 550 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TULP3O75386 442 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 FAM163BP0C2L3 166 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 YWHAQP27348 245 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TUBP50607 506 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TNNC1P63316 161 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF33AQ06730 810 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ERICH6BQ5W0A0 696 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 FAM35AQ86V20 835 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CGRRF1Q99675 332 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ATP8B3O60423 1300 aa13.04□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 A8MXQ7 604 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 ZNF217O75362 1048 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC5A3P53794 718 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 PROSER1Q86XN7 944 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 NUP93Q8N1F7 819 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CLIC6Q96NY7 704 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 DEC1Q9P2X7 70 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 CACNA1GO43497 2377 aa13.03□□□□□ -0.32
AL355500.1-201ENST00000439421 A0A087X0B3 334 aa13.02□□□□□ -0.33
AL355500.1-201ENST00000439421 A0A1W2PQD8 194 aa13.02□□□□□ -0.33
AL355500.1-201ENST00000439421 A0A1W2PQF6 199 aa13.02□□□□□ -0.33
AL355500.1-201ENST00000439421 CLDN5O00501 218 aa13.02□□□□□ -0.33
AL355500.1-201ENST00000439421 ARHGAP33O14559 1287 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms