RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 KRT82Q9NSB4 513 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 ABL1P00519 1130 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 NR2F2P24468 414 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 NDST1P52848 882 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 INCA1Q0VD86 236 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 ACOT1Q86TX2 421 aa22.09■■□□□ 1.13
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UBXN4-204ENST00000426921 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 NETO1Q8TDF5 533 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 HHIPQ96QV1 700 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 MED10Q9BTT4 135 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 EBF1Q9UH73 591 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 EML5Q05BV3 1969 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 COCHO43405 550 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 AP1G2O75843 785 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 CLSTN1O94985 981 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 HLA-DRAP01903 254 aa22.08■■□□□ 1.13
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UBXN4-204ENST00000426921 PIK3CAP42336 1068 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 VAMP7P51809 220 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 DMC1Q14565 340 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 DHCR24Q15392 516 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.08■■□□□ 1.13
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UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 SMOQ99835 787 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN4-204ENST00000426921 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 E2F8A0AVK6 867 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 K7EQS6 105 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 AXIN1O15169 862 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 EPN2O95208 641 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 APBB3O95704 486 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 HECTD3Q5T447 861 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 USP33Q8TEY7 942 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 OTUB2Q96DC9 234 aa22.07■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.07■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 CCDC192P0DO97 292 aa22.06■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 KBTBD6Q86V97 674 aa22.06■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.06■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 ZNF202O95125 648 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 TRIM49CP0CI26 452 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 C12orf29Q8N999 325 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 TWNKQ96RR1 684 aa22.05■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.05■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0A0MRY4 1105 aa22.04■■□□□ 1.12
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UBXN4-204ENST00000426921 FAM200BP0CF97 657 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 ADH5P11766 374 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 GCLMP48507 274 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 PLK5Q496M5 336 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 RASSF3Q86WH2 238 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 PNKPQ96T60 521 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBXN4-204ENST00000426921 HHLA1C9JL84 531 aa22.03■■□□□ 1.12
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