RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CTDSP2-201ENST00000398073 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 APOC2P02655 101 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CPA3P15088 417 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ATICP31939 592 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BACE1P56817 501 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 XRCC4Q13426 336 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PDK4Q16654 411 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ADRB2P07550 413 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNA2P16389 499 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PNPLA4P41247 253 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZPBP2Q6X784 338 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 THAP1Q9NVV9 213 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RARBP10826 455 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC15A2Q16348 729 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 IPMKQ8NFU5 416 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR18Q9BV38 432 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PAX7P23759 505 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAT5Q09328 741 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83AQ86UY5 434 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAAP100Q0VG06 881 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ACAP1Q15027 740 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ADRM1Q16186 407 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOT1Q86TX2 421 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GID8Q9NWU2 228 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 F8VP50 259 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLCO1B7G3V0H7 640 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CHKAP35790 457 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 INPP1P49441 399 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MAMLD1Q13495 774 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMB3Q13751 1172 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 IFNEQ86WN2 208 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SPON2Q9BUD6 331 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LIASO43766 372 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB5P36952 375 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD5Q6N075 450 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MIEF2Q96C03 454 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF711Q9Y462 761 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINE1P05121 402 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SNHG28P0DPA3 235 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RAP1GAPP47736 663 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 M0QYT0 321 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ANXA9O76027 345 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GJB6O95452 261 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 STAG3L1P0CL83 205 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TAF6P49848 677 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CLCN3P51790 818 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 NFIL3Q16649 462 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 RMDN1Q96DB5 314 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAR2Q96K12 515 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 EGFL8Q99944 293 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BTKQ06187 659 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CNBD2Q96M20 576 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM200BP0CF97 657 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC39Q96DD0 335 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2-201ENST00000398073 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms