RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 LYPLA2O95372 231 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 BORCS6Q96GS4 357 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.1■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 SULT1E1P49888 294 aa16.1■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 POTEAQ6S8J7 498 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 MON1BQ7L1V2 547 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 MMP8P22894 467 aa16.1■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP6O75344 327 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 BBS12Q6ZW61 710 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0B4J269 797 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 E9PBE3 544 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 HIC2Q96JB3 615 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 HSD17B4P51659 736 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRU-201ENST00000345512 DCAF6Q58WW2 860 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 EME1Q96AY2 570 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 PORCNQ9H237 461 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 C2CD2Q9Y426 696 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-201ENST00000345512 AVILO75366 819 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms