RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304101.8

KCNS3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-201ENST00000304101 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 A0A1W2PQY0 241 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 E5RJQ4 531 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 AKAP5P24588 427 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CENPUQ71F23 418 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RFX6Q8HWS3 928 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CYP4X1Q8N118 509 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 C12orf29Q8N999 325 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 DEFB118Q96PH6 123 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CALN1Q9BXU9 219 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RSAD1Q9HA92 442 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 EURLQ9NYK6 297 aa21.45■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 APOC2P02655 101 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 BRAFP15056 766 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CDC42EP1Q00587 391 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PDE4CQ08493 712 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TAF5Q15542 800 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TRIP11Q15643 1979 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GDF10P55107 478 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC142Q17RM4 750 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SNX27Q96L92 541 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.44■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PIK3R2O00459 728 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ALOX15BO15296 676 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FSBPO95073 299 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PFKMP08237 780 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PDGFRAP16234 1089 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 LRRC14Q15048 493 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 NOTUMQ6P988 496 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 NME8Q8N427 588 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 MGARPQ8TDB4 240 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RNF39Q9H2S5 420 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 KLK14Q9P0G3 267 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 M0QZ92 97 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 C1QTNF8P60827 252 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 HIF1AQ16665 826 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PEBP4Q96S96 227 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SCN1AP35498 2009 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 MCF2LO15068 1137 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PRMT2P55345 433 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TRNP1Q6NT89 227 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 GHRP10912 638 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 TDRPQ86YL5 185 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 BEST2Q8NFU1 509 aa21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
KCNS3-201ENST00000304101 RNF208Q9H0X6 261 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms