RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 PTPN9P43378 593 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 UPP1Q16831 310 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 DSTYKQ6XUX3 929 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PIGZQ86VD9 579 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TEKT4Q8WW24 435 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 NCAPGQ9BPX3 1015 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SQORQ9Y6N5 450 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 LHX1P48742 406 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC29A2Q14542 456 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 BOLA3Q53S33 107 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 MDH1BQ5I0G3 518 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SCYL2Q6P3W7 929 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TSPYL1Q9H0U9 437 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 RIPK2O43353 540 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 CAND2O75155 1236 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 HDAC4P56524 1084 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PLCB3Q01970 1234 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 DPYSL3Q14195 570 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 P3H1Q32P28 736 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PGBD4Q96DM1 585 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TMEM121Q9BTD3 319 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 CENPHQ9H3R5 247 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 CRTAC1Q9NQ79 661 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TSC2P49815 1807 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 NPR3P17342 541 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC8A3P57103 927 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 MMRN1Q13201 1228 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TBCBQ99426 244 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 GNRH1P01148 92 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 POMCP01189 267 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 APOC2P02655 101 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 ETS1P14921 441 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT71Q3SY84 523 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 AGBL2Q5U5Z8 902 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SYT15Q9BQS2 421 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 BEST1O76090 585 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 INHAP05111 366 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PDK2Q15119 407 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PKNOX2Q96KN3 472 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 MED10Q9BTT4 135 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAM7Q9H2U9 754 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 PCDH9Q9HC56 1237 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.33■■□□□ 1.97
FOXQ1-201ENST00000296839 SGK1O00141 431 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 SKIP12755 728 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 CAPN2P17655 700 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 SKOR1P84550 965 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT81Q14533 505 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 CKBP12277 381 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ADIGQ0VDE8 80 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 GRIK3Q13003 919 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 EFHC1Q5JVL4 640 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 EMC10Q5UCC4 262 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 LHX8Q68G74 356 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 CLEC20AQ6ZU45 233 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 MAP7D3Q8IWC1 876 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 KCTD13Q8WZ19 329 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAM33Q9BZ11 813 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 MDM4O15151 490 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ADCY1Q08828 1119 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 HOOK3Q86VS8 718 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ECHDC2Q86YB7 292 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 NR1D1P20393 614 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 GPS1Q13098 491 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 TFDP2Q14188 446 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 RNF157Q96PX1 679 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 CDH9Q9ULB4 789 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXQ1-201ENST00000296839 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms