RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K10Q02779 954 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CHI3L2Q15782 390 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TSC22D3Q99576 134 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TRIM4Q9C037 500 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GGA3Q9NZ52 723 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ASMTLO95671 621 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SSTR1P30872 391 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RAP1GAPP47736 663 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CLDN10P78369 228 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 VCX3AQ9NNX9 186 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 DONSONQ9NYP3 566 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 POLIQ9UNA4 740 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SBF2Q86WG5 1849 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 B2RBV5 119 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 APOEP02649 317 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ETS1P14921 441 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SULT1E1P49888 294 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ACAD11Q709F0 780 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PYGBP11216 843 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CCNB1P14635 433 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TYK2P29597 1187 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RGS7P49802 495 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 DEUP1Q05D60 604 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 RAPH1Q70E73 1250 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPATA24Q86W54 205 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 METTL23Q86XA0 190 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 FAM172AQ8WUF8 416 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TEKT4Q8WW24 435 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPDL1Q96EA4 605 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 OLFM3Q96PB7 478 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZFATQ9P243 1243 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 THEGQ9P2T0 379 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.19□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD13C9JR72 458 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 APOA4P06727 396 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 POLBP06746 335 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CXCL8P10145 99 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MYL2P10916 166 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 PAMP19021 973 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GRK2P25098 689 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 AP1B1Q10567 949 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 MAP7Q14244 749 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SV2CQ496J9 727 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LY75O60449 1722 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 LACTBL1A8MY62 500 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 BIRC5O15392 142 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 KITP10721 976 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 BGNP21810 368 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ADRA1DP25100 572 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ADORA2BP29275 332 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A3Q01959 620 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 EMC1Q8N766 993 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 APPL2Q8NEU8 664 aa9.18□□□□□ -0.94
HERC3-201ENST00000264345 REPS2Q8NFH8 660 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.3 ms