RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ERVV-1B6SEH8 477 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 CCDC166P0CW27 439 aa16.58■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 CCDC126Q96EE4 140 aa16.58■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R16BQ96T49 567 aa16.58■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 INTS13Q9NVM9 706 aa16.58■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 CHKBQ9Y259 395 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 A8MUI8 341 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 PDK1Q15118 436 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.57■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 UBDO15205 165 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTIF-201ENST00000256413 DGKDQ16760 1214 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 ERFEQ4G0M1 354 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 EXD1Q8NHP7 514 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 VPS33AQ96AX1 596 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 SNAP23O00161 211 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 DCXO43602 365 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PIK3R1P27986 724 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 PTGER2P43116 358 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 HSD17B4P51659 736 aa16.56■□□□□ 0.24
CTIF-201ENST00000256413 NME5P56597 212 aa16.56■□□□□ 0.24
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