RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 UCHL3P15374 230 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 HDCP19113 662 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CLCN1P35523 988 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 AVPR1AP37288 418 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BCAT1P54687 386 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 NMUR1Q9HB89 426 aa23.51■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 COL4A2P08572 1712 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CYP26A1O43174 497 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PFKLP17858 780 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G4AP47712 749 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 STILQ15468 1287 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SCD5Q86SK9 330 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 HESX1Q9UBX0 185 aa23.5■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 MYO16Q9Y6X6 1858 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 COL4A3Q01955 1670 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SHISA7A6NL88 538 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TEX33O43247 280 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 USP17L7P0C7H9 530 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 GDI1P31150 447 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 GPD2P43304 727 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A9P82251 487 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PMF1Q6P1K2 205 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 LUZP1Q86V48 1076 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.49■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 HELZP42694 1942 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PRR33A8MZF0 331 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 COCHO43405 550 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ABL1P00519 1130 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SETSIPP0DME0 302 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TCF3P15923 654 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SYCP1Q15431 976 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF77Q15935 545 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZFYVE19Q96K21 471 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TRPV5Q9NQA5 729 aa23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQH9 124 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 M0QYV0 167 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 DPYSL4O14531 572 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CHADO15335 359 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CKMP06732 381 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TPM2P07951 284 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 GNA15P30679 374 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 USP8P40818 1118 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TUBP50607 506 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 UBXN1Q04323 297 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 HECTD3Q5T447 861 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 STK33Q9BYT3 514 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 BRD9Q9H8M2 597 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CYLDQ9NQC7 956 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 CA14Q9ULX7 337 aa23.47■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZNF263O14978 683 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TBX18O95935 607 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 RFX1P22670 979 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TKTL1P51854 596 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SLC8A3P57103 927 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 USP4Q13107 963 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 MEA1Q16626 185 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SIX5Q8N196 739 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms