RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K FYV4P38783 130 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K KNH1P50112 268 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL193CP53097 103 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR268CQ08734 132 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K PPT2Q12036 173 aa1.62□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR415CO13578 112 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K SCM4P32564 187 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K MID2P36027 376 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K GTT1P40582 234 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL190WP53872 204 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K DDR2P89113 61 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K HPA2Q06592 156 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YLL006W-AQ3E814 58 aa1.61□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K QCR8P08525 94 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K CPR1P14832 162 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K HOT13P36078 116 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YKR041WP36134 250 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX17P40155 199 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPS12P53732 153 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K CMC4Q3E7A9 73 aa1.6□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K MBF1O14467 151 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K ARO2P28777 376 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL073CP40323 161 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YFR057WP43625 151 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL257WQ08974 193 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K KSH1Q8TGJ3 72 aa1.59□□□□□ -2.15
tW(CCA)KtW(CCA)K ATP5P09457 212 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K HAP3P13434 144 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K KRE1P17260 313 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YCR007CP25354 239 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K UGX2P32772 223 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL067CP39978 195 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR020W-AQ3E824 90 aa1.58□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YER039C-AP0CD97 72 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K COX10P21592 462 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K UBC11P52492 156 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K BSC4P53841 131 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K SEN15Q04675 128 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR007C-AQ07074 71 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL023C-AQ2V2P3 75 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL162W-AQ3E7A8 72 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR230W-AQ3E7B5 62 aa1.57□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL29P05747 59 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL44P19956 98 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K SSS1P35179 80 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR027CP38220 110 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K SPG1P50088 95 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YNR077CP53758 84 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K PAU17Q12370 124 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR034C-AQ3E735 80 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR121W-AQ3E816 71 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YIL134C-AQ45U18 67 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K IGO2Q9P305 131 aa1.56□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC11P15367 167 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL33P20084 86 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K SPT4P32914 102 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YIA6P40556 373 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YJR085CP47131 105 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC21Q04772 201 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MET32Q12041 191 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR230W-AQ3E762 66 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL127C-BQ3E828 52 aa1.55□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR139C-AO13536 103 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K MSL1P40567 111 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K ICY1Q04329 127 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K ISU2Q12056 156 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YAL063C-AQ3E791 96 aa1.54□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K BET1P22804 142 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K FYV5P25585 152 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL044WP36092 106 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL230CP53074 147 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K RGM1Q00453 211 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K CNL1Q06333 122 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR072WQ08486 104 aa1.53□□□□□ -2.16
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K PAU23Q07987 124 aa1.52□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K YHL005CP38752 130 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K MPC3P53311 146 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K NAT5Q08689 176 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL157CQ12082 118 aa1.51□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR130CP38834 111 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL184CP53876 108 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K ELC1Q03071 99 aa1.5□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K DUT1P33317 147 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM18P40033 138 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K YML108WQ03759 105 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K COA6Q3E846 104 aa1.49□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K COX7P10174 60 aa1.48□□□□□ -2.17
tW(CCA)KtW(CCA)K FUN14P18411 198 aa1.48□□□□□ -2.17
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