RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	GIM5	Q04493	163 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	ATP16	Q12165	160 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PAU17	Q12370	124 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.42	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	BET1	P22804	142 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	CNB1	P25296	175 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YKR032W	P36127	104 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	GPX2	P38143	162 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	SHG1	P38337	142 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	PEX17	P40155	199 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YKE4	P40544	346 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	UBC12	P52491	188 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YNL184C	P53876	108 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.41	□□□□□ -2.34
PAM16	YJL104W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ARG80	P07249	177 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	QCR8	P08525	94 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ATP5	P09457	212 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ATP15	P21306	62 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	FYV5	P25585	152 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	AHT1	P29589	182 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU13	P38725	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YEL067C	P39978	195 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SFT1	P43682	97 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SRB7	P47822	140 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU4	P53427	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	DAD3	P69850	94 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU10	Q03050	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SHH4	Q06236	168 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU20	Q08322	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.4	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PFY1	P07274	126 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SRP21	P32342	167 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YBR242W	P38331	238 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	TDA2	P40045	126 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	IES5	P40060	125 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YPL073C	P40323	161 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	OST2	P46964	130 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	TAD2	P47058	250 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ILM1	P47155	203 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	MPC3	P53311	146 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.39	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	GOS1	P38736	223 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SRP14	P38985	146 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	TOS6	P48560	102 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YGL118C	P53132	145 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	APS2	Q00381	147 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ANT1	Q06497	328 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ATP14	Q12349	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.38	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YGL010W	P25338	174 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YBR090C	P38253	122 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PHS1	P40857	217 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	HHO1	P53551	258 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	HPA2	Q06592	156 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	PAU23	Q07987	124 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.37	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	SEC11	P15367	167 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	LDS1	P31379	325 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YHL042W	P38729	150 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	HSP10	P38910	106 aa		0.36	□□□□□ -2.35
PAM16	YJL104W	YPL080C	Q02826	108 aa		0.36	□□□□□ -2.35

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