RNA–Protein interactions for RNA: YER132C

PMD1, Transcript of Protein with an N-terminal kelch-like domain, yeast

Gene PMD1, Length 5,262 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMD1	YER132C	PAU21	P0CE86	164 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU22	P0CE87	164 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	SPS18	P32572	300 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	CPR5	P35176	225 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	RPB11	P38902	120 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	EST3	Q03096	181 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	ARG80	P07249	177 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YHR173C	P38864	112 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	VMA21	P41806	77 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	MPC3	P53311	146 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU1	P0CE88	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU14	P0CE89	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU6	P0CE90	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU18	P0CE91	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU8	P0CE92	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU11	P0CE93	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	FPR2	P32472	135 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU2	P32612	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	TIM12	P32830	109 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU24	P38155	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU13	P38725	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAM16	P42949	149 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	CWP2	P43497	92 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU12	P53343	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU10	Q03050	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	FCY1	Q12178	158 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	PAU9	Q3E770	120 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	COX8	P04039	78 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	YDL157C	Q12082	118 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	SEC59	P20048	519 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	TVP18	Q04767	167 aa		0.97	□□□□□ -2.25
PMD1	YER132C	HHY1	P39982	102 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	GPI19	Q04082	140 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR296W	Q05898	108 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	CCW12	Q12127	133 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	MIC27	P50945	234 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	PAU4	P53427	120 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YMR320W	Q04897	101 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	GPI11	Q06636	219 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	MOT1	P32333	1867 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	AVO2	Q04749	426 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	COX5B	P00425	151 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	DAN1	P47178	298 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.96	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YJL009W	P47078	108 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	MIX17	Q03667	156 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	PAM17	P36147	197 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YGL235W	P53071	178 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SFT2	P38166	215 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YHL005C	P38752	130 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YGL204C	P53089	101 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	UBC5	P15732	148 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.95	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	PFY1	P07274	126 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	HPM1	P40481	377 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YBL071C	P38185	102 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	DAD1	Q12248	94 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	HUR1	P45820	110 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	ORM1	P53224	222 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YKL044W	P36092	106 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YOR105W	Q08504	108 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SBH1	P52870	82 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SNN1	P48232	102 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YDR042C	Q03205	200 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YCR050C	P25630	102 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YKR045C	P36138	183 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YDR278C	Q05612	105 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	MRP17	P28778	131 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SLM6	P38343	150 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	SDH6	Q3E785	79 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PMD1	YER132C	YLR042C	Q07990	161 aa		0.92	□□□□□ -2.26

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