RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	MTFR1	Q15390	333 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	AMHR2	Q16671	573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HBP1	O60381	514 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KRT16	P08779	473 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CILP	O75339	1184 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NEFH	P12036	1026 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ADRA1D	P25100	572 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM237	Q96Q45	408 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MIS12	Q9H081	205 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MGRN1	O60291	552 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LGR5	O75473	907 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GSTA1	P08263	222 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FGFR1	P11362	822 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GPD2	P43304	727 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PHKA2	P46019	1235 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	C22orf31	O95567	290 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MSH2	P43246	934 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KRT81	Q14533	505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ELK3	P41970	407 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	BNIP1	Q12981	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	NPHS2	Q9NP85	383 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HES2	Q9Y543	173 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	HCRT	O43612	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CYP3A5	P20815	502 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	PHB	P35232	272 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	ROR1	Q01973	937 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	USP4	Q13107	963 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SMTN-222	ENST00000612341	CRYM	Q14894	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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