RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		5	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397		A0A087WWL8	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397		A0A088AWK7	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PSMD9	O00233	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	CES2	O00748	559 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ADAM10	O14672	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PRF1	P14222	555 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PSG6	Q00889	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PMPCB	O75439	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MT-CO3	P00414	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PHKG2	P15735	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	GK	P32189	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	OFD1	O75665	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	SCP2	P22307	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ARFIP2	P53365	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	RAB1A	P62820	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	CTBP1	Q13363	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MLC1	Q15049	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	BTN3A1	O00481	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ABLIM3	O94929	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PF4V1	P10720	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CCNI	Q14094	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	RNF8	O76064	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LMAN2	Q12907	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397		M0R3H8	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	AP1G1	O43747	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	NPR1	P16066	1061 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	HTR1B	P28222	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	BCAT1	P54687	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TIMM9-210	ENST00000557397	MIDN	Q504T8	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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