RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
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PTPRK-218ENST00000525459 NOMO3P69849 1222 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 ADIGQ0VDE8 80 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 IRGQQ8WZA9 623 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 SYT11Q9BT88 431 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRK-218ENST00000525459 POMKQ9H5K3 350 aa19.7■□□□□ 0.74
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