RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	ARSA	P15289	507 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	RFX1	P22670	979 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	AVPR1A	P37288	418 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R2	P41236	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	USP4	Q13107	963 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	YAF2	Q8IY57	180 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM122A	Q96E09	287 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	IL37	Q9NZH6	218 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	GMIP	Q9P107	970 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TULP2	O00295	520 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	STX10	O60499	249 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	OLFM2	O95897	454 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ABL1	P00519	1130 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CKM	P06732	381 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HDC	P19113	662 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	YWHAQ	P27348	245 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HOXC13	P31276	330 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PTPN5	P54829	565 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	APBA1	Q02410	837 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CUL2	Q13617	745 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MTF1	Q14872	753 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM3C	Q92520	227 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXO32	Q969P5	355 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	WBP2	Q969T9	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SHD	Q96IW2	340 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	OSER1	Q9NX31	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM92A	A1XBS5	289 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	LEFTY2	O00292	366 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP26A1	O43174	497 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CTH	P32929	405 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GAS6	Q14393	721 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PON2	Q15165	354 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CLDN23	Q96B33	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NMUR1	Q9HB89	426 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MDM4	O15151	490 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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