RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 HYAL2Q12891 473 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KRT31Q15323 416 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CCDC142Q17RM4 750 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TCP11X2Q5H9J9 407 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SPOPLQ6IQ16 392 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 LILRA6Q6PI73 481 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 OSTM1Q86WC4 334 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 GLYCTKQ8IVS8 523 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PDCL2Q8N4E4 241 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PLD4Q96BZ4 506 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TMEM169Q96HH4 297 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 HPDLQ96IR7 371 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SENP8Q96LD8 212 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TTPALQ9BTX7 342 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 RBSNQ9H1K0 784 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CBX8Q9HC52 389 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TLR9Q9NR96 1032 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FANCLQ9NW38 375 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FNIP2Q9P278 1114 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 MTRRQ9UBK8 725 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.8□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 OBSL1O75147 1896 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KPNA7A9QM74 516 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KCNJ18B7U540 433 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 P4HA2O15460 535 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TEX28O15482 410 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TACC1O75410 805 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TADA2AO75478 443 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 NOL4O94818 638 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ABLIM3O94929 683 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 GNA14O95837 355 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 C1RP00736 705 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TNNC2P02585 160 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TNNI1P19237 187 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 WARSP23381 471 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PAX3P23760 479 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ATICP31939 592 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PNPLA4P41247 253 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 GLUD2P49448 558 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ZNF165P49910 485 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CLCN4P51793 760 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 INCA1Q0VD86 236 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KCNJ12Q14500 433 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 USP41Q3LFD5 358 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FAM171A1Q5VUB5 890 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 WSCD1Q658N2 575 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KRT39Q6A163 491 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 LUZP1Q86V48 1076 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FBXL13Q8NEE6 735 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SPATA18Q8TC71 538 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KAT5Q92993 513 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 ZNF560Q96MR9 790 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FNBP1Q96RU3 617 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TMEM209Q96SK2 561 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TCF25Q9BQ70 676 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 CLEC1BQ9P126 229 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 STK39Q9UEW8 545 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.79□□□□□ -1.48
MSRA-208ENST00000522907 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms