RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NELL1	Q92832	810 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TATDN2	Q93075	761 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB20	Q9NX57	234 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014		R4GN57	208 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYH10	P35580	1976 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCAM2	O15394	837 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFRA3	O60609	400 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1G2	O75843	785 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKM	P06732	381 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PFKL	P17858	780 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	HDC	P19113	662 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC5A3	P53794	718 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC7A9	P82251	487 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RUNX3	Q13761	415 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCIN	Q13939	588 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	EML3	Q32P44	896 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSG101	Q99816	390 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARID3A	Q99856	593 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF292	O60281	2723 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLSTN1	O94985	981 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD58	P19256	250 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	YWHAQ	P27348	245 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP3CC	P48454	512 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PON2	Q15165	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZS52	159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEFTY2	O00292	366 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	BIN1	O00499	593 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMA7	O14818	248 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADORA2B	P29275	332 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXC13	P31276	330 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD23B	P54727	409 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2H	P62256	183 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SATB1	Q01826	763 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBR7	Q8N806	425 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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