RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MYRIPQ8NFW9 859 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 OR56A3Q8NH54 315 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LZTS1Q9Y250 596 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 AOX1Q06278 1338 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PCSK5Q92824 1860 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF213O14771 459 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TPP1O14773 563 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 VNN1O95497 513 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MAN1A1P33908 653 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CACNB3P54284 484 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LY6KQ17RY6 165 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 RNF220Q5VTB9 566 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CEP85Q6P2H3 762 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MICU3Q86XE3 530 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FANCBQ8NB91 859 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 HASPINQ8TF76 798 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TBC1D5Q92609 795 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 REPS1Q96D71 796 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SUCLG2Q96I99 432 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TARM1B6A8C7 271 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FRS3O43559 492 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM27P14373 513 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TPTEP56180 551 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CNGA2Q16280 664 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PCID2Q5JVF3 399 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 IL31Q6EBC2 164 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ERAP2Q6P179 960 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ABRAQ8N0Z2 381 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DDB2Q92466 427 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DPF1Q92782 380 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SPSB4Q96A44 273 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 OBP2AQ9NY56 170 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SCINQ9Y6U3 715 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01548A6NM66 108 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ISM1B1AKI9 464 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZBED1O96006 694 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PRKCGP05129 697 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NPSP0C0P6 89 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CTGFP29279 349 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TRAPPC10P48553 1259 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 NEK3P51956 506 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 CYP4F2P78329 520 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TFF2Q03403 129 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PICALMQ13492 652 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 GBX1Q14549 363 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZWC4 215 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 STK31Q9BXU1 1019 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-215ENST00000506510 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms