RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	UTY	O14607	1347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TLR2	O60603	784 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDE8B	O95263	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	AMY1A	P04745	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CETP	P11597	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRMT2	P55345	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PROK1	P58294	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOMO3	P69849	1222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	VGLL4	Q14135	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCL15	Q16663	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	HTT	P42858	3142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAP2A	P10114	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SESN3	P58005	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPAT	Q06203	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPIL2	Q13356	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIF22	Q14807	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	USP7	Q93009	1102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CENPF	P49454	3210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MGAM	O43451	1857 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANP32C	O43423	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZEB2	O60315	1214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	POMC	P01189	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP5J	P18859	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FGFR2	P21802	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOXD10	P28358	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ECHS1	P30084	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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