RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PCSK4Q6UW60 755 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 OR7D4Q8NG98 312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ADI1Q9BV57 179 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NAPBQ9H115 298 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BCO1Q9HAY6 547 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MCM9Q9NXL9 1143 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 HACL1Q9UJ83 578 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FLT1P17948 1338 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF213O14771 459 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF185O15231 689 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PJA2O43164 708 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MARCH6O60337 910 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PRKD3O94806 890 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RHOBTB3O94955 611 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CYP21A2P08686 494 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RAP2AP10114 183 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA4P34932 840 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PLCD1P51178 756 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CLRN1P58418 232 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MXRA7P84157 204 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ADCK5Q3MIX3 580 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CHST3Q7LGC8 479 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TICAM2Q86XR7 235 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TEX101Q9BY14 249 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 LANCL2Q9NS86 450 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ECM29Q5VYK3 1845 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MYH1P12882 1939 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 UNC119BA6NIH7 251 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ADM5C9JUS6 153 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 E7EWF7 191 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GPR39O43194 453 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DOAP06340 250 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 OSMP13725 252 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BMP5P22003 454 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CHN2P52757 468 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A3P53794 718 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 USP14P54578 494 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SP140Q13342 867 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PRKG1Q13976 671 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NOMO1Q15155 1222 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ALX1Q15699 326 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf60Q5U649 245 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZVL8 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 KCNK18Q7Z418 384 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ATL2Q8NHH9 583 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC2Q9BYS8 371 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 GGA3Q9NZ52 723 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-211ENST00000484135 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.5□□□□□ -1.53
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