RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	LILRA4	P59901	499 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	OGDH	Q02218	1023 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CHST7	Q9NS84	486 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DSE	Q9UL01	958 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NFS1	Q9Y697	457 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TSC2	P49815	1807 aa		10.1	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM170A	A1A519	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CFAP69	A5D8W1	941 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MYADML2	A6NDP7	307 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	INPPL1	O15357	1258 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FBXO21	O94952	628 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KRT14	P02533	472 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	APOC2	P02655	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ASGR1	P07306	291 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PFKM	P08237	780 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PDGFRA	P16234	1089 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	NR1D1	P20393	614 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KDELR1	P24390	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	AKAP5	P24588	427 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PCSK1	P29120	753 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CTGF	P29279	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MIP	P30301	263 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ADCY8	P40145	1251 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	LMAN1	P49257	510 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GRIK3	Q13003	919 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TRADD	Q15628	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	C4orf22	Q6V702	233 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ACOT1	Q86TX2	421 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KCTD6	Q8NC69	237 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PGM2	Q96G03	612 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	FAM161B	Q96MY7	647 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	SRRD	Q9UH36	339 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UFD1-208	ENST00000484101	GABRQ	Q9UN88	632 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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