RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 WHAMMQ8TF30 809 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 EXOC4Q96A65 974 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PATJQ8NI35 1801 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF10BO14763 440 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GFRA3O60609 400 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PAEPP09466 180 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CCDC130P13994 396 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 NPR3P17342 541 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PSEN1P49768 467 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 RAD23BP54727 409 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TAF10Q12962 218 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GRM2Q14416 872 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 STILQ15468 1287 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 C12orf29Q8N999 325 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TATDN2Q93075 761 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 KCNK16Q96T55 309 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 DUSP16Q9BY84 665 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 56.7
PRAME-211ENST00000476336 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TADA3O75528 432 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PTMSP20962 102 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SLC5A3P53794 718 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K7CLP57077 242 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SLC7A9P82251 487 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PDGFRLQ15198 375 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SGO2Q562F6 1265 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PJA1Q8NG27 643 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 LMO3Q8TAP4 145 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GPT2Q8TD30 523 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 FBXO32Q969P5 355 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TWNKQ96RR1 684 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SMOQ99835 787 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 IER2Q9BTL4 223 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GCNT4Q9P109 453 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 HESX1Q9UBX0 185 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CFAP54Q96N23 3096 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ARNTLO00327 626 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 LRRN2O75325 713 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PRAMEF12O95522 483 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 OLFM2O95897 454 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 VDRP11473 427 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ADORA2BP29275 332 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 NBL1P41271 181 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CACNA2D1P54289 1103 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 USP46P62068 366 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 NR1H3Q13133 447 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 MAN2A1Q16706 1144 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ZNF394Q53GI3 561 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 HECTD3Q5T447 861 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 GBP6Q6ZN66 633 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ZNF276Q8N554 614 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ARID3AQ99856 593 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ANO10Q9NW15 660 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 SCML2Q9UQR0 700 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-211ENST00000476336 ABL1P00519 1130 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms