RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	OLFM2	O95897	454 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CKM	P06732	381 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP93	Q8N1F7	819 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL37	Q9NZH6	218 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM92A	A1XBS5	289 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHAD	O15335	359 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	P4HA2	O15460	535 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNA14	O95837	355 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARSA	P15289	507 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	YWHAQ	P27348	245 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PFKP	Q01813	784 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTF1	Q14872	753 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRF7	Q92985	503 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	WBP2	Q969T9	261 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	F5	P12259	2224 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959		O00370	1275 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	COCH	O43405	550 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABL1	P00519	1130 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9A1	P19634	815 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFX1	P22670	979 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLCN5	P51795	746 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF132	P52740	706 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FZD5	Q13467	585 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	THAP9	Q9H5L6	903 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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