RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 VITQ6UXI7 678 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 OBP2AQ9NY56 170 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 OBSL1O75147 1896 aa22.64■■□□□ 1.22
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF263O14978 683 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 USP17L7P0C7H9 530 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 KRT5P13647 590 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 HDCP19113 662 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 GDI1P31150 447 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TDP1Q9NUW8 608 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CA14Q9ULX7 337 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CKMP06732 381 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PFKLP17858 780 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 RFX1P22670 979 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SIX5Q8N196 739 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 IRF7Q92985 503 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 VPS16Q9H269 839 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 IL37Q9NZH6 218 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SYCE3A1L190 88 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 C2orf78A6NCI8 922 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 STK25O00506 426 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PRAMEF12O95522 483 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 KRT31Q15323 416 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 STILQ15468 1287 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 GJB7Q6PEY0 223 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SMTNL1A8MU46 457 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 USP8P40818 1118 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BCAT1P54687 386 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TTC16Q8NEE8 873 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SHDQ96IW2 340 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 GMIPQ9P107 970 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 FAM92AA1XBS5 289 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 HHLA1C9JL84 531 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 O00370 1275 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CHADO15335 359 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 APBA1Q02410 837 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CNGA2Q16280 664 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 HECTD3Q5T447 861 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 FBXL6Q8N531 539 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 UBA3Q8TBC4 463 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SLC22A12Q96S37 553 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 SCML2Q9UQR0 700 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 CCL26Q9Y258 94 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 NCANO14594 1321 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF165P49910 485 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 KIF11P52732 1056 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PDE4CQ08493 712 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 NCAPHQ15003 741 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 PIGZQ86VD9 579 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TTC30AQ86WT1 665 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 FLCNQ8NFG4 579 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-202ENST00000460308 TFAP2BQ92481 460 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms