RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC175P0C221 793 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTSAP10619 480 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LAMP2P13473 410 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NID1P14543 1247 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRK2P25098 689 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCND2P30279 289 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCAR1P56945 870 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRN3Q13033 797 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FZD5Q13467 585 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAT4Q14765 748 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCB4Q15147 1175 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STPG1Q5TH74 334 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF3Q5VWG9 929 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARM1Q6UWI2 310 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C12orf40Q86WS4 652 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITFG2Q969R8 447 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLDN23Q96B33 292 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF2CQ99661 725 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAPBQ9H115 298 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRN3Q9NYV6 651 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SQORQ9Y6N5 450 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APC2O95996 2303 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACACAQ13085 2346 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERICH4A6NGS2 130 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0QZ92 97 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INPPL1O15357 1258 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BRINP1O60477 761 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 B4GALT3O60512 393 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJA2O60884 412 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAM11O75078 769 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COQ9O75208 318 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KA5O75582 802 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDAH1O94760 285 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM153BP0C7A2 387 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLFN14P0C7P3 912 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INSRRP14616 1297 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GNAT2P19087 354 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FNTBP49356 437 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBASH3AP57075 661 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GHRHRQ02643 423 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP2R5CQ13362 524 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM14Q14142 442 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RETSATQ6NUM9 610 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM228AQ86W67 206 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTD1Q8N815 330 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF169Q8NCN4 708 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCEAL3Q969E4 200 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNX21Q969T3 373 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM169Q96HH4 297 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms