RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.29□□□□□ -1.24
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USP40-202ENST00000409945 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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USP40-202ENST00000409945 LOC285556D6RIA3 1793 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP40-202ENST00000409945 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP40-202ENST00000409945 MAN2A1Q16706 1144 aa7.26□□□□□ -1.25
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USP40-202ENST00000409945 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 SVIPQ8NHG7 77 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 FAM227BQ96M60 508 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 BCO1Q9HAY6 547 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.26□□□□□ -1.25
USP40-202ENST00000409945 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.26□□□□□ -1.25
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