RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLCD1P51178 756 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 BCAT1P54687 386 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSG6Q00889 435 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC13A2Q13183 592 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTBP1Q13363 440 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB32Q13637 225 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 LY6KQ17RY6 165 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q4G0T1 1027 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 AWAT2Q6E213 333 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF398Q8TD17 642 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 COQ8BQ96D53 544 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 HMCESQ96FZ2 354 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 NT5C1BQ96P26 610 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMFRQ9UKV5 643 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM232C9JQI7 657 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSMD9O00233 223 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 SOCS2O14508 198 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 FCHO1O14526 889 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 AKAP10O43572 662 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMPCBO75439 489 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 NTN1O95631 604 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGAP02671 866 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 A1BGP04217 495 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHKG2P15735 406 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL1R2P27930 398 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCNIQ14094 377 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 MLC1Q15049 377 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 RABEP1Q15276 862 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 C4orf46Q504U0 113 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAML1Q92585 1016 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 WACQ9BTA9 647 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDH19Q9H159 772 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF180Q9UJW8 692 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM233B4DJY2 109 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 CES2O00748 559 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 DSCR3O14972 297 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBC1D4O60343 1298 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCATO75600 419 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFPL1O75677 317 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUSC2O75896 110 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGBP02675 491 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 KITP10721 976 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPHA3P29320 983 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 LMAN2Q12907 356 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 TWIST1Q15672 202 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 NPNTQ6UXI9 565 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPARTQ8N0X7 666 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPP5Q8N3R9 675 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL31RAQ8NI17 732 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-601P-201ENST00000384540 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms