RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PHBP35232 272 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP1BP68106 108 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PPARDQ03181 441 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 BFSP1Q12934 665 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SPP2Q13103 211 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PWP1Q13610 501 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RCN2Q14257 317 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MESDQ14696 234 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 USP37Q86T82 979 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TRABD2AQ86V40 505 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LCA5Q86VQ0 697 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 VPS52Q8N1B4 723 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SHDQ96IW2 340 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IWS1Q96ST2 819 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OSMRQ99650 979 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SYT15Q9BQS2 421 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAF1Q9H063 256 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EURLQ9NYK6 297 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COG5Q9UP83 839 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GYG2O15488 501 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MED24O75448 989 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HAUS5O94927 633 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 IL1BP01584 269 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EDN3P14138 238 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA8P53708 1063 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 XIAPP98170 497 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MGAT5Q09328 741 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CCNG2Q16589 344 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KYNUQ16719 465 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CGB2Q6NT52 195 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PCGF5Q86SE9 256 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 LDHDQ86WU2 507 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ERO1BQ86YB8 467 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf82Q8WW14 230 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAML1Q92585 1016 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NKD1Q969G9 470 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COA7Q96BR5 231 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NSL1Q96IY1 281 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MAML3Q96JK9 1138 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 VPS11Q9H270 941 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TRABDQ9H4I3 376 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM206Q9H813 350 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 AAASQ9NRG9 546 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 DMAC2Q9NW81 257 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 GMEB1Q9Y692 573 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 OTOFQ9HC10 1997 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL11O14625 94 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TGFB1I1O43294 461 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 ATP9AO75110 1047 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CIB2O75838 187 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 PSMG1O95456 288 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 TSHRP16473 764 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 KRT15P19012 456 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CA4P22748 312 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD13P35453 343 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 COPB2P35606 906 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CASP5P51878 434 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA2D1P54289 1103 aa7.53□□□□□ -1.2
CTPS1-201ENST00000372616 MFAP3P55082 362 aa7.53□□□□□ -1.2
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